肉瘊子可以通过药物治疗、物理治疗或手术方式去除。具体方法需根据瘊子的大小、位置及个体情况选择，多数情况下经过规范处理可有效清除。
药物治疗适用于较小的肉瘊子。常见外用药膏具有腐蚀或免疫调节作用，能促使疣体脱落。使用前需清洁患处，涂抹药物后避免接触健康皮肤。若瘊子位于面部或黏膜等敏感部位，需在专业人员指导下选择刺激性较小的药物。药物治疗通常需持续数周，期间可能出现局部轻微红肿，属正常反应。
物理治疗包括冷冻、激光等方法。液氮冷冻通过低温使疣体坏死脱落，适合体积中等的瘊子，治疗间隔需两周左右，较大瘊子可能需多次处理。激光治疗精准度高，适用于顽固性或特殊部位的瘊子，术后需保持创面干燥以防感染。这两种方式恢复期约一周，可能遗留暂时性色素沉着。
手术切除适用于直径较大或疑似恶变的瘊子。传统切除术可在局麻下完成，伤口需缝合，愈合约需两周。电灼术通过高温去除病变组织，操作时间短但术后结痂需自然脱落。所有手术方式均需严格消毒，避免疤痕增生。
日常预防需注意避免直接接触感染者衣物，保持皮肤完整。发现瘊子增大、出血时应及时就医，不可自行撕扯。治疗后定期观察原部位及周围皮肤，防止复发。不同去除方法各有利弊，选择时需综合考虑效果、恢复时间及经济因素。
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